Als nächstes erfolgt die Konfiguration der virtuellen Festplatte. Virtualbox unterstützt zahlreiche virtuelle Festplattenformate. Wer einen späteren Umzug der virtuellen Maschine zu Microsoft oder VMware plant, wählt das entsprechende Format aus. Ansonsten belässt man es bei der Standardeinstellung. Die Art der Speicherung "dynamisch alloziert" oder "feste Größe" lässt sich ebenfalls bestimmen. Mint benötigt zwar nur 11 GByte Festplattenspeicher, 20 GByte werden aber empfohlen.